《新还珠格格》的大结局情感交织，扣人心弦。小燕子和萧剑、晴儿班杰明一同前往大理，开启了新的生活。萧剑和晴儿喜结连理，而小燕子则给了永琪两年时间，让他回宫为额娘和欣荣留下了一个孩子。欣荣最终生下一个儿子，名为绵亿。老佛爷接纳了紫薇，并封她为明珠格格，与尔康喜获赐婚。在绵亿满月后，永琪离开皇宫，踏上了前往大理的旅程，寻找他深爱的小燕子。
在漫长的逃亡过程中，福尔康、永琪和班杰明经历了无数艰险。他们的劫囚行动引发乾隆的追捕，众人被迫踏上逃亡之路。在逃亡中，紫薇因头部受伤而失明，但她在尔康受伤后奇迹般地恢复了视力。箫剑带着小燕子等人到牧场务工，但因冲突引来追兵，他们只好继续逃亡。最终，永琪与小燕子重逢，他们在南阳开设了面馆。当乾隆来到南阳欲迎接他们回宫时，却发生了小燕子的杀父仇人是乾隆的误会。最终，误会得以澄清，但永琪因宫廷责任不得不回宫。他和小燕子约定了两年的等待时间，期间他写下了730封信给小燕子，每封信都寄托着他对小燕子的思念和爱意。
最终，永琪完成了自己的任务后征求皇上同意去找小燕子。他到达大理时，看到小燕子在花海中拉小提琴。他们重逢的那一刻，仿佛时间静止，两人深情相拥。班杰明默默祝福他们，然后离开回到大不列颠国。与此皇宫中的其他人也各自找到了自己的归宿。紫薇和尔康的爱情得到了圆满，他们过上了幸福的生活。
相比之下，《旧还珠格格》的结局同样充满了情感的碰撞和交融。小燕子以其机智和口才与皇上力争，最终与永琪这对有情人得以相守。而紫薇和尔康也同样找到了自己的幸福。两个版本的结局都展现了爱情的力量和人性的光辉，让观众为之动容。
这样的剧情设计既充满了情感的波折，又展现了人性的善良和美好。无论是新版还是旧版，《还珠格格》都成为了无数人心中永恒的经典。